Ich finde den Sachverhalt schwierig, da der TE erst nach und nach mit den Facts um die Ecke kommt. Was am Ende bleibt, ist, dass Hyundai Deutschland dem Vertragshändler nicht bestimmen kann, das dieser ein technisch abweichendes Fahrzeug repariert.
Der einfachste Weg ist, wie @Matze61 schon mehrmals angeführt hat, eine andere Werkstatt zu suchen. Es kann ja auch eine freie Werkstatt sein, da eine Garantie keine Rolle mehr spielt.